全身麻醉停止给药后，患者一般在60～90分钟当可获得清醒，对指令动作、定向能力和术前的记忆得以恢复。若超过此时限神志仍不十分清晰，可认为全麻后苏醒延迟。引起全麻后苏醒延迟的常见原因有药物作用时间的延长、高龄、患者全身代谢性疾病、中枢神经系统的损伤等。
对于不同的手术，手术麻醉后遗症也不相同。比如有些手术麻醉造成的后遗症是头痛。就像做腰部手术麻醉的时候是可能造成后期头疼的情况的。有些手术麻醉有可能导致感染。也可能由于患者对药物的排斥导致药物的中毒。就像硬膜外手术的麻醉一样。还有些手术麻醉可能造成低血压等等。
全麻恢复期，大多数患者呈嗜睡、安静或有轻度定向障碍和脑功能逐渐恢复趋于正常，但仍有部分患者出现较大的情感波动，表现为不能控制的哭泣和烦躁(躁动)不安。躁动的出现除了与术前、术中用药有关外，术后疼痛等可能是引起躁动的重要因素。
全身麻醉恢复期，随着麻醉药作用的消退、疼痛不适，以及吸痰、拔除气管内导管的刺激等原因极易引起高血压的发生。尤其先前有高血压病史者，且多始于手术结束后30分钟内。如果在术前突然停用抗高血压药物，则发生高血压情况更呈严重。发生高血压的原因包括：疼痛、低氧血症与高碳酸血症、术中补充液体超荷和升压药应用不当、吸痰的刺激、和其他如术后寒战，尿潴留膀胱高度膨胀等。
术后恶心与呕吐是麻醉后很常见的问题，造成患者的不适而影响休息，其发生率为20%～30%，既往有相关病史、女性和吸入麻醉相对发生率高。
在麻醉过程和手术后均可发生急性支气管痉挛，表现为支气管平滑肌痉挛性收缩，气道变窄，气道阻力骤然增加，呼气性呼吸困难，引起严重缺氧和CO2蓄积。若不即时予以解除，患者因不能进行有效通气，不仅发生血流动力学的变化，甚至发生心律失常和心跳骤停。
